Jejaring.org menyediakan sertifikat SSL gratis yang dapat digunakan pada website organisasi nirlaba. SSL memungkinkan adanya enkripsi, sehingga lalu lintas data antara visitor dengan server lebih aman. 

Sertifikat yang dipergunakan Jejaring.org memakai StartSSL. Berlaku tanpa biaya untuk organisasi nirlaba. Fitur ini diberikan secara khusus bersama dengan dedicated IPv4 address. Organisasi nirlaba perlu mengajukan fasilitas ini secara terpisah beserta alasan teknis/non teknis untuk dievaluasi urgensinya oleh Jejaring.org.